شبیه‌سازی دینامیک مولکولی یکی از روش‌های پیشرفته محاسباتی است که به پژوهشگران امکان می‌دهد رفتار و حرکات اتم‌ها و مولکول‌ها را مطالعه کنند. این تکنیک در زمینه های مختلفی از طراحی دارو تا علوم مواد کاربردهای گسترده‌ای دارد.

نرم‌افزار گرومکس (Gromacs) به عنوان یکی از قدرتمندترین و پرکاربردترین ابزارهای شبیه سازی دینامیک مولکولی شناخته می‌شود که با سرعت اجرای بهینه و قابلیت‌های پیشرفته، امکان شبیه‌سازی سیستم‌های مولکولی پیچیده را فراهم می‌کند و انتخاب خوبی برای پروژه‌های تحقیقاتی بزرگ محسوب می‌شود.

برای پژوهشگران و دانشجویانی که قصد دارند در زمینه ی شبیه‌سازی دینامیک مولکولی فعالیت کنند، تسلط بر نرم‌افزار گرومکس یک مزیت مهم محسوب می‌شود. این دوره با ارائه محتوای کاربردی، مسیر یادگیری این نرم‌افزار قدرتمند را برای شما هموار خواهد ساخت.

سر فصل‌های دوره: 

- آشنایی با نرم افزار گرومکس شامل روش نصب، انواع فایل ها و انواع کامندها

- روش شبیه سازی پروتئين در آب با استفاده از نرم افزار گرومکس

- روش شبیه سازی کمپلکس پروتئين-لیگاند در آب با انواع فورس فیلدها، با استفاده از نرم افزار گرومکس

- روش گرفتن خروجی ها، رسم نمودارها و تفسیر نتایج حاصل از شبیه سازی دینامیک مولکولی با نرم افزار گرومکس

ویژگی‌های دوره:

- آموزش‌ها به‌صورت بسیار روان و گام‌به‌گام ارائه می‌شوند و حتی افرادی که هیچ پیش‌زمینه‌ای در این حوزه ندارند، می‌توانند به‌راحتی مطالب را فرا بگیرند.

- تمامی مفاهیم از سطح پایه به‌طور کامل و با جزئیات بیان می‌شوند تا شرکت‌کنندگان درک عمیقی از موضوعات پیدا کنند.

- مثال‌های عملی و کاربردی در طول دوره ارائه می‌شوند تا یادگیری را تسهیل کرده و مهارت‌های کاربردی را تقویت کنند.

مدرس: 

- دکتر نجمه فانی، پژوهشگر و مؤسس مرکز پژوهش‌های رایانه‌ای ایلیا  
مدارک تحصیلی:
- لیسانس شیمی محض از دانشگاه صنعتی شریف  
- کارشناسی ارشد و دکتری شیمی فیزیک از دانشگاه صنعتی اصفهان  

- گذراندن دو سال دوران پسادکتری به حمایت بنیاد ملی نخبگان و به میزبانی دانشگاه اصفهان
افتخارات:
- دارنده مدال برنز المپیاد شیمی کشوری  
- دانش‌آموخته ممتاز در دوران کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری  
- برگزیده حمایت تشویقی ستاد نانو  
-  کسب عنوان پژوهشگر برتر جوان در علوم پپتیدی و پروتئینی  
- دریافت کننده جایزه شهید چمران از بنیاد ملی نخبگان

سوابق علمی و حرفه ای:
- مؤلف و مشاور در بیش از صد مقاله ISI در زمینه ی داکینگ مولکولی، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی و مدلسازی پروتئین‌ها
- تأسیس مرکز پژوهش‌های رایانه‌ای ایلیا
- برگزاری کارگاه های آموزشی در دانشگاه ها و مراکز تحقیقاتی داخل و خارج از کشور

- راه‌اندازی سرورهای محاسباتی پرسرعت
- ارائه خدمات مشاوره‌ای تخصصی برای پروژه‌های تحقیقاتی